Кабинет Михаила Фрадкова. Неофициальный взгляд на официальных людей   ::   Мухин Алексей Алексеевич

25 мая 1999 года Указом Президента РФ Фрадков вернулся на госслужбу — был назначен министром торговли РФ в правительстве Сергея Степашина . С 25 сентября 1999 года, одновременно, Фрадков занял пост представителя РФ в исполкоме союза России и Белоруссии, а с июля 1999 года стал заместителем председателя российской части — сопредседателем комитета по развитию делового сотрудничества Российско-Американской комиссии по экономическому и технологическому сотрудничеству.

После отставки Правительства Степашина с 9 августа 1999 года Фрадков являлся и.о. министра торговли РФ. 19 августа 1999 года Указом Президента РФ он вновь был назначен министром торговли РФ в Правительстве Владимира Путина .

6 сентября 1999 года Фрадков опять был включен в состав Комиссии при Президенте РФ по вопросам военно-технического сотрудничества с иностранными государствами.

С 1 января по 7 мая 2000 года Фрадков исполнял обязанности министра торговли РФ, а 7 мая 2000 года правительство В.Путина ушло в отставку. В новый состав правительства (председатель — Михаил Касьянов) Фрадков не вошел, а министерство торговли было вообще упразднено (функции переданы в Минэкономразвития).

31 мая 2000 года Фрадков был назначен первым заместителем секретаря Совета Безопасности РФ и вошел в команду Сергея Иванова . До этого, по некоторым данным, его прочили на пост заместителя министра по экономическому развитию и торговли. В Совбезе Фрадков курировал вопросы экономической безопасности.